使君子存在一定毒性，禁忌人群主要包括孕妇、婴幼儿、脾胃虚弱者、过敏体质者以及肝肾功能不全者。使君子为传统驱虫中药，其有效成分可能引起胃肠刺激、神经系统抑制等不良反应，使用前需严格遵医嘱。
使君子中的使君子酸钾等成分可能刺激子宫平滑肌，增加流产或早产风险。孕妇使用可能导致腹痛、阴道出血等先兆流产症状，妊娠期驱虫应选择更安全的替代方案，如遵医嘱使用复方甲苯咪唑片等药物。
3岁以下儿童肝肾功能发育不完善，代谢毒素能力较差。使君子可能引发婴幼儿呕吐、嗜睡、抽搐等中毒反应，该年龄段驱虫推荐使用宝塔糖（磷酸哌嗪宝塔糖）等儿童专用制剂，家长需严格核对用药剂量。
慢性胃炎、肠易激综合征患者服用使君子易加重腹胀、腹泻等症状。其油脂成分会刺激胃肠黏膜，诱发恶心呕吐，此类人群驱虫可考虑阿苯达唑颗粒等胃肠刺激性较小的药物，建议餐后服用减轻不适。
使君子蛋白可能引发荨麻疹、喉头水肿等过敏反应。既往对植物蛋白过敏者用药前需进行皮试，出现皮肤瘙痒、呼吸困难应立即停用并就医，可替换为盐酸左旋咪唑片等低致敏性驱虫药。
肝硬化、肾衰竭患者代谢毒素能力下降，使用使君子可能导致毒素蓄积中毒。临床表现为黄疸、少尿等症状，此类患者驱虫应选择双羟萘酸噻嘧啶片等不经肝肾代谢的药物，并定期监测肝肾功能指标。
健康人群使用使君子时需控制单次用量不超过10克，避免空腹服用。服药期间忌食油腻辛辣食物，若出现头晕、心悸等中毒症状应立即就医。日常预防寄生虫感染应注意饮食卫生，生熟食材分开处理，蔬菜水果充分洗净，儿童玩耍后及时清洁双手，集体生活场所定期进行环境消杀。
